خلاصه‌ای از پژوهش
بیماری‌های عصبی-عضلانی (NMD) که در کودکی آغاز می‌شوند، با ضعف عضلات تنفسی و ناتوانی در پاکسازی هوایی همراه هستند. این موارد معمولاً منجر به عفونت‌های مکرر و کلونیزاسیون مزمن می‌شود که همواره فرهنگ‌گیری منفی، چند میکروبی یا هر دو هست. میکروبیوم ریه می‌تواند یک مدل یکپارچه ارائه دهد: تغییرات در مهاجرت، حذف و رشد میکروب‌ها ممکن است منجر به دیسبیوز و گسترش پاتو بیونت و مقاومت به آنتی‌بیوتیک‌ها (AMR) شود.
ما پیشنهاد می‌کنیم که NMD در کودکان ممکن است یک مسیر توسعه‌ای خاص را دنبال کند که در آن ایستایی ترشحات در اوایل زندگی، آسیب‌های ویروسی و مصرف مکرر آنتی‌بیوتیک‌ها مکالمه‌های ایمنی-میکروبیوم را در هنگام رشد ریه‌ها مختل می‌کند و احتمالاً ساختار جامعه میکروبی را به طور طولانی‌مدت «مالکیت» می‌کند.
محدودیت‌های مطالعه
- کمبود داده‌های میکروبیوم خاص NMD، به دلیل تکیه بیشتر مطالعات بر فرهنگ یا نمونه‌گیری از مجاری هوایی فوقانی.
- نیاز به کنترل‌های با بیومس پایین و روش‌های پالایش برای کاهش خطای بالای خواندن در توالی‌یابی.
- نسبت بالای DNA میزبان در نمونه‌های تنفسی که در نتیجه تنها ۱-۵٪ از کل خواندن‌ها به باکتری‌ها تعلق دارد.
در نهایت، ما اصول میکروبیوم مرتبط با NMD کودکانه را بررسی کرده، شواهد فعلی را خلاصه نموده و طراحی‌های مطالعه و اولویت‌های ترجمه‌ای را که با استفاده از تکنولوژی توالی‌یابی ONT امکان‌پذیر است، توضیح می‌دهیم.